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作为无经验的新手学生,在生化实验室中,前几周时间花在洗玻璃器皿和黏贴试管标签上。后来过渡到配制各种实验步骤的缓冲液和母液。最后,叫你负责一个蛋白质的纯化,这是柠檬酸循环中的一个酶,位于Mi基质中的柠檬酸合酶。按照一个纯化程序,你根据下列步骤进行。在你工作的时候,一个更有经验的学生问你每一步步骤的基本原理,请提供答案
(1)你从附近的屠宰场买到20kg的牛心脏,在冰上带回,在冰上进行每一个步骤。你用高速匀浆器在含0.2M蔗糖,pH7.2的缓冲液中使牛心组织匀浆
问:你为什么使用牛心组织,且用那么大的量?
将组织保持低温状态和悬浮在0.2M的蔗糖, pH7.2的缓冲液中的目的是什么?
当组织匀浆后发生了什么变化?
(2)你把得到的牛心匀浆用一系列的差速离心,这是什么目的?
(3)你继续用含大多为完整Mi的上清液纯化。接着,你用渗透法裂解Mi,裂解液主要为Mi膜和线粒体内容物组成,对此裂解液,你加入中性盐至特定浓度,然后离心,收集上清液,在上清液中继续加入中性盐,然后离心,保留沉淀,沉淀中含有要分离的蛋白质
问:两步加中性盐的原理是什么?
(4)你把沉淀物重新溶解,用大体积的pH7.2的缓冲液透析过夜。
问:为什么此步骤中透析缓冲液中不加中性盐,
为什么使用缓冲液而不是水?
(5)你将透析后的溶液进行凝胶过滤层析,根据方法,你收集从柱子上下来的第一个组分,弃去其它的组分。你检测各组分蛋白质是通过紫外吸收法。
问:你收集第一个组分这一操作告诉你关于这个蛋白质的什么信息
为什么OD280是检测洗脱组分中蛋白质的存在的方法
(6)你把上一步中收集到的组分进行阳离子交换。当除去开始流出柱子的溶液后,你在柱中加入较高pH值的洗脱液,然后收集流出液,解释你在干什么
(7)你将所得样品进行等电点聚焦电泳,然色后,胶上表现出三条清晰的带。根据经验,感兴趣的蛋白质的PI为5.6,但你决定再测一下蛋白质的纯度,你把PI5.6的带切下,进行SDS-PAGE,此蛋白质表现出单一带。
问:为什么你不能确定等电点聚焦后的单条带是纯品?
SDS的结果告诉你什么?
为什么在等电聚焦后还要跑SDS-PAGE
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