R语言 LiuJason'sBlog-Page 4

R语言中使用readOGR读取shp文件坐标转换|经纬度值很大

我在绘制比利时海岸线的研究地点地图时，下载了geo.be的shp文件，使用如下代码导入的时候出现了问题：经纬度值非常大be_map <- readOGR("SiteMap/resources/AD_3_District.shp")这是由于使用的坐标系不同导致的，因此需要做转换：be_map <- spTransform(be_map, ……

02-27 Check now

R语言中scale_shape_manual图例|ggplot2

……

01-26 Check now

[已解决]libudunits2.so was not found安装sf时报错|CentOS

安装sf的时候出现如下错误：checking udunits2.h usability... nochecking udunits2.h presence... nochecking for udunits2.h... nochecking udunits2/udunits2.h usability... nochecking udunits2/u……

01-25 Check now

[已解决]"proj_api.h presence and usability... no"安装proj-devel——R语言中GIS包rgdal的依赖包|CentOS7为例

首先看这里：https://www.liujason.com/article/152.html然后，ssh里安装gdal-devel, proj-devel, proj-nad, proj-epsglibgdal.so问题：cp /usr/local/lib/libgdal.so.20* /usr/lib64/libkmldom.so问题：wget……

01-20 Check now

R语言中在表格中显示Tukey HSD事后检验的分组结果|和SPSS一样可视化ANOVA方差分析

在多层次方差分析之后，我们可能需要看看到底是哪些处理组之间有显著差异，或者虽然ANOVA结果是显著的但是我们还要看看哪些处理组之间是不显著的，这种时候我们就需要TukeyHSD事后检验了。用过SPSS的人应该知道，SPSS的事后检验结果非常的人类友好——可读性很高，会把每个层次的处理告诉你，但是R自带的结果就非常不友好了...我拿同一组数据在R和SPSS里跑……

12-14 Check now

Centos7上的SF安装——GIS依赖包

依赖列表gdal> = 2.1＃用于数据结构geos> = 3.5＃用于数据操作pro4j＃用于投影udunits＃为单位的PostgreSQL [可选]lwgeom [可选]＃对于geohashCentos7默认仓库为您提供gdal1.1，geos 2.x. 但是，sf :: st_voronoi需要geos> =……

12-08 Check now

[已解决]"checking for gdal-config... no" 安装gdal2.x——R语言中GIS包rgdal的依赖包|CentOS7为例

在编译R环境的时候，最讨厌的额就是一些特殊的依赖包，只能通过ssh安装，而且还经常找不到这些包或者是版本不匹配...这次的gdal 2.x就是一个例子，浪费了我很长的时间去找相关的安装方法，这里记一下笔记，下次碰到了的话就方便了。这里还是强烈建议，安装各种包之前看一看包的介绍：packages/rgdal。有很明确的说明需要什么样子的环境：for bu……

12-07 Check now

使用ggplot2中的分面参数facet对数据进行分类作图/分页/一页多图

最近在整理文章用到的分析的代码，准备发表的时候一并上传给大家作参考，所以要仔细检查有没有错误或者是可以优化代码的地方。这里给大家介绍一下ggplot2里一个超级好用的参数：facet。用过R的应该都知道，普通的绘图我们可以用par(nfrow())来进行分页，但是这一方法在ggplot2中并不适用，事实上ggplot2的facet更加好用一些，可以自动帮你……

12-02 Check now

使用R语言插入缺失数据-平均值法(附代码)

做实验嘛总会莫名其妙少掉一些样本，但是样本少了文章还是要写啊！那么缺失了数据对分析有什么影响呢？我觉得最重要的影响应该是权重的变化，这里用我这次的实验数据做例子吧：本实验是研究9个不同来源地（纬度梯度下）的植物凋落物分解速率的差异，同时还有3种不同的凋落物袋看分解者和来源地的交互作用，具体可以看这个poster：Poster (draft) of [R……

11-30 Check now

[已解决]ERROR: dependencies * are not available for package |installation of package had non-zero exit status

[问题]Rstudio-Server 在安装一些程序包的时候经常会出现这种错误ERROR: dependencies ‘jpeg’, ‘png’ are not available for package ‘qgraph’* removing ‘/home/liujason/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/……

11-29 Check now