海洋浮游植物分布数据的获取及使用-Continuous Plankton Recorder Survey LiuJason'sBlog

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前言
数据库简介
数据集的空间与时间划分
采样方法
查询数据可用性

前言

因为目前课题是有关海洋浮游植物的，需要获取到欧洲北海地区浮游植物分种的历史分布情况及丰度，对于observation而言有很多数据库可以操作，比如Ocean Biogeographic Information System (OBIS)，就能很方便的获取到各种海洋生物的观测记录（点击查看R代码），我在本博客里后续也会做一些介绍（欢迎右侧搜索关键词OBIS查看）。

仅仅是observation的话是不够的，我还需要每个物种的丰度情况，来确定具体的研究对象，OBIS的数据模板中虽然有“个体数量”（"individual count"）这个变量，但是北海区域是缺失的。

所以我们找到了这个数据库——Continuous Plankton Recorder Survey。

文章比较长（慢更中），没必要全部看完，请用左上角的目录定位到自己需要的地方。

数据库简介

Continuous Plankton Recorder Survey（CPR）调查是世界上运行时间最长的海洋生物监测计划之一。该调查由Alister Hardy爵士和Cyril Lucas爵士于1931年发起，是在整个海洋范围内为海洋科学家提供浮游生物群落数据的计划。如今，CPR调查由位于英国普利茅斯的海洋生物协会（MBA）进行。自1948年以来，CPR调查的采样和浮游生物分析方法就一直保持统一，提供了时空全面的超过80年的海洋浮游生物动力学记录。

目前项目已经并入了Marine Biological Association（海洋生物协会），官方介绍如下：

点击展开

如果有兴趣的话可以看看他们2018年的海报：
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数据集的空间与时间划分

采样地理区域划分

CPR将大西洋海域根据纬度划分为A-F六个纬度带，再根据经度划分为多个区域，具体划分图如下：

在查询数据可用性的时候，根据上图确定自己的目标区域可以获得更加准确的可用性描述。

采样时间

有过出海采样经历的同行可能知道，海洋生物调查的站点是受到航行约束的，特别是远洋调查。因此即使是一个定期调查项目，也会因为种种原因部分站点的数据缺失。

上图是截止2001年，每年的CPR采样长度和样品数量情况，二战期间停了一段时间。

上图是1995-1999年的站点分布情况，下图是2011年成立全球联盟后的数据站点情况。可以看出站点数量是在逐渐增加的，但是也意味着现在的一些站点没有较长的历史数据，如果想要做长时间跨度的对比研究的话，就需要找那些有老站点了（通常北大西洋区域的数据都是时间跨度很长的）。

采样方法

为了实现长时间连续采样，CPR的设计者Alister Hardy发明了一个浮游植物连续采样装置（Continuous Plankton Recorder）。没错就是CPR的核心！让我很惊讶的是这个装置和磁带录音机的机械构造一样，通过转动滚轮来实现连续的记录，设计图：

Alister Hardy在发现者号（RRS Discovery）上与CPR原型（Type I）的合照：

查询数据可用性

CPR在官网上提供了数据可用性查询查询工具，可以通过筛选时间（点击进入）查看各个站点的采样强度：

也可以通过选择地理区（点击进入）来查看历史数据的可用性情况：

This article is under CC BY-NC-SA 4.0 license.
Please quote the original link：https://www.liujason.com/article/611.html

前言